O UniFOA estimula a busca de recursos nos órgãos que fomentam a Iniciação Científica no país. Dentre esses órgãos se destacam o Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq, a Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à  Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro - FAPERJ entre outros. Contudo, a Reitoria do UniFOA tem concedido bolsas, que dependerão da qualidade/impacto dos trabalhos, dos currículos dos docentes e discentes envolvidos e etc. O procedimento para sua obtenção está condicionado às regras estabelecidas pelos órgãos de fomento em questão e pela avaliação dos membros do Núcleo de Pesquisa do UniFOA. Mais informações podem ser encontradas no site do UniFOA, em Pesquisa .

O aluno de Iniciação Científica deve solicitar ao Orientador que avalie as possibilidades de obtenção da bolsa perante os órgãos de fomento. As solicitações de bolsas aos órgãos podem, em alguns casos, ser efetuadas em qualquer período do ano (denominadas de fluxo contínuo), enquanto que em outros estão condicionadas à  publicação de editais específicos. As bolsas concedidas pelo UniFOA serão do tipo Fluxo Contínuo e deverão obedecer às normas contidas no Edital da Iniciação Científica do UniFOA.

É importante lembrar, entretanto, que a Iniciação Científica pode ser realizada em regime de voluntariado, independentemente da existência de uma bolsa de apoio.